Mideniz küçüldüğünden dolayı bazı gıda maddelerini yeteri kadar alamama durumu olabilir. Bazı hastalarda barsak sistemi emilim kapasitesini arttırdığı için mide küçültme ameliyatında vitamin desteği gerekmeyebilir.
Oluşabilecek eksiklik durum bazı vitaminlerin düzenli takibi yada semptomların değerlendirilmesiyle anlaşılabilir. Ama bu durum by-pass cerrahisi geçiren kişiler için tamamen farklıdır. Alımın yanında emilim alanının da kısıtlı olması nedeniyle ameliyattan sonra uzun bir süre multi-vitamin desteği almanız gerekecektir.